L’aeroporto Mactan International di Cebu (sigla CEB) è quello più vicino a Malapascua. Molte compagnie aeree volano dall’Italia (Roma e Milano) su Cebu: Emirates, Cathay Pacific, Singapore, Malaysia, Korean, Kuwait, Saudia, Etihad, Qatar.
Dall’aeroporto Mactan International di Cebu ci sono circa 144 km di strada asfaltata per arrivare a Maya, il porto più vicino a Malapascua. Il porto dista meno di 8 chilometri dall’isola.